Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNERQ8NFT8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms