Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms