Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF397Q8NF99 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms