Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46DQ8NEK8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46DQ8NEK8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms