Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COLGALT1Q8NBJ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COLGALT1Q8NBJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms