Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLRC2Q8NBF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms