Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP11CQ8NB49 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP11CQ8NB49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP11CQ8NB49 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms