Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP38Q8NB14 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms