Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1KQ8N3J5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1KQ8N3J5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms