Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVBPQ8N300 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms