Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms