Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU68

TMC8, Transmembrane channel-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC8Q8IU68 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC8Q8IU68 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC8Q8IU68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms