Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF39Q86UA1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms