Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX7Q7RTT5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms