Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM43BQ6ZT52 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms