Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms