Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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CSAG1Q6PB30 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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CSAG1Q6PB30 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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CSAG1Q6PB30 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CSAG1Q6PB30 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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