Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms