Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF544Q6NX49 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms