Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD16Q68DU8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms