Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E4F1Q66K89 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E4F1Q66K89 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4F1Q66K89 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms