Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf84Q5VXU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
C9orf84Q5VXU9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf84Q5VXU9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms