Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SUSD4Q5VX71 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD4Q5VX71 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms