Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms