Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC38Q5R3I4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
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