Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA2Q53GA4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms