Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM30BQ3MIR4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM30BQ3MIR4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms