Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL67

PARP6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP6Q2NL67 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP6Q2NL67 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP6Q2NL67 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms