Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB5Q2M3G0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB5Q2M3G0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms