Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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