Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK4Q16099 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK4Q16099 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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