Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms