Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE4AQ14139 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms