Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIRBPQ14011 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBPQ14011 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBPQ14011 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBPQ14011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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