Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
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SHROOM2Q13796 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHROOM2Q13796 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
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