Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SF3B2Q13435 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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