Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSLNQ13421 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSLNQ13421 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms