Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGDRQ13258 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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