Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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