Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1BQ13112 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1BQ13112 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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