Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ACACAQ13085 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACACAQ13085 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms