Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNIP3Q12983 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3Q12983 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP3Q12983 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP3Q12983 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP3Q12983 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3Q12983 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3Q12983 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3Q12983 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms