Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTN1Q12860 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN1Q12860 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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