Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STX4Q12846 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STX4Q12846 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STX4Q12846 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
STX4Q12846 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX4Q12846 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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STX4Q12846 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX4Q12846 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX4Q12846 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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