Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMA1Q12791 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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