Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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GTF3C1Q12789 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GTF3C1Q12789 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GTF3C1Q12789 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GTF3C1Q12789 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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