Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK18Q07002 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms