Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51Q06609 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms