Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms