Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACVR1Q04771 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACVR1Q04771 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1Q04771 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1Q04771 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1Q04771 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1Q04771 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1Q04771 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1Q04771 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms